恐怖分子阿布·伊斯梅尔目前是汗尤尼斯旅管理与指挥的核心人物，在9月初汗尤尼斯旅指挥官穆罕默德·亚祖里被击毙后，其地位更加突出。
与加沙地带的其他医院类似，位于汗尤尼斯的纳赛尔医院被哈马斯利用。例如，该医院的二楼被用作哈马斯的军事指挥部，平民不得入内且守备严密，专门供该组织的指挥官使用，其中包括穆罕默德·阿布·伊斯梅尔。在整个战争期间，数十名人质被关押在纳赛尔医院，其中许多人来自纳哈尔奥兹基布兹，包括妇女、儿童、老年人和外国公民。
此外，在整个战争期间，他还负责关押许多人质，其中包括人质：尼姆罗德·科恩、马坦·赞高克、伊丹·亚历山大、阿夫拉哈姆·曼吉斯托、已故阿萨夫·哈马米上校、奥兹·丹尼尔军士长以及已故奥梅尔·诺伊特拉上尉。
在打击阿布·伊斯梅尔的同时，身处医院大楼建筑群内的其他恐怖分子也遭到了袭击，其中包括战斗与行政支援连工程部班长穆阿瓦德·陶菲格·马哈茂德·阿布·扎里法，以及哈马斯情报总部行动部通信科科长哈立德·乌萨马·阿布·安扎。
这些恐怖分子将纳赛尔医院建筑群改造成指挥部，并从内部策划针对以军部队的数十起恐怖袭击计划，试图重整在战争期间遭受重创的该旅战斗力；以军随即对其发动空袭以消除威胁。
在袭击发生前，军方采取了预防措施，以尽可能减少对医院建筑及未涉事人员的伤害。此外，袭击还对该旅长与恐怖分子进行军事行动的房间进行了精准打击。
此外，在发动袭击前，以色列国防军曾多次（包括近期）重申、警告并要求停止在医院内的军事活动。尽管有这些警告，医院内的军事活动并未停止。